自动启停系统是一种能够智能控制机器设备运行的系统，它可以根据设定的条件自动启动或停止设备，从而使得设备的运行更加高效、节能。然而，这种系统也存在着一些缺点，下面我们来一一分析。

首先，自动启停系统需要进行大量的设定和调试工作，尤其是在安装初期，需要对系统进行多次试运行，以确保其正常工作。这对于非专业人士来说，可能会存在一定的困难，因此需要专业技术人员进行安装和调试。

其次，自动启停系统对于设备的适配性要求较高，需要与设备的相关参数进行匹配，以确保能够准确控制设备运行。因此，如果设备的参数发生了变化，就需要重新进行系统的调整和设定。

另外，自动启停系统也存在着一定的故障风险，如果系统出现故障，可能会导致设备无法正常运行，甚至产生安全隐患。因此，在安装和使用自动启停系统时，需要进行充分的风险评估，并采取相应的措施来降低故障风险。

综上所述，自动启停系统虽然可以提高设备的效率、节能，但也存在着一些缺点。因此，在考虑安装和使用自动启停系统时，需要充分评估其优缺点，确保其能够满足实际需要。